Например, чтобы можно было в сonfig.txt все hotkeys самому поменять на что угодно.
А то неудобно, когда куча программ и у них пересекающиеся горячие клавишы(emacs?

Pop-up window мне вообще ни одна из предложенных алтернатив не подходит.

2) Почему-то если окно уже открыто на десктопе 1, а я перехожу на другой десктоп и кликаю на иконке, окно goldendict
не прыгает на активный десктоп. Тоже неудобно.
3) Почему-то при нажатии на зум шрифты в статьях меняются, а вот в панели поиска слева нет. Странно. Кстати, как их там вообще можно поменять/увеличить?
А вообще огроменное спасибо! Программа супер.
Кстати, у Stardict есть полезная фича -- по нажатию иконки/ клавишы слово записывается в файл ~/dic.txt на новую строчку.
Потом можно этот файл читать и проверять, какие слова запомнил, а какие нет.